Seal on palju kõrgkoolidele kogu Kõrgõzstani. See hõlmab ligi kolmkümmend seitse avalik-õiguslike ülikoolide ja kaheksateist eraülikoolide. Silmapaistev ülikoolide Kõrgõzstan hulka Ülikooli Kesk-Aasia ja Kirgiisi Riiklik Ülikool.

Doktoriõppe programmi nõuete hulka kuulub tavaliselt juba olemasolev magistrikraad. Lisaks tuleb esitada lõputöö või väitekiri, mille sisuks on originaalne akadeemiline uurimistöö. Mõnedes riikides on lõputööd vaja ka ekspertide paneeli ees kaitsta.